تأسس المجلس التخصصي للجمعيات الصحية بموجب اعتماد المركز الوطني لتنمية القطاع غير الربحي بقرار رقم (203520-9) بتاريخ 1440/11/13 ، ليكون الذراع التخصصي الناظم للجمعيات الصحية في المملكة. جامها تحت مظلته ما يزيد عن 468 جمعية ومؤسسة أهلية تعنى بالصحة. من منطلق الحاجة إلى مظلة تجمع جهود الجمعيات الصحية الأهلية في المملكة، وتوحد صوتها نحو التمكين والتكامل، عمل المجلس على تمثيل وتمكين هذه الجمعيات، وتنسيق الجهود بينها، بما يسهم في تعزيز الأثر الصحي والمجتمعي في المملكة.